De institutioner, der har et særligt stort behov for RejsUd, vil blive opprioriteret i arbejdet med tilpasning af RejsUd-opsætningen til de nye strukturer. Hvis ikke man når at få lavet en ny RejsUd-opsætning inden 1. januar 2012, må institutionen fortsætte i den gamle struktur.
For at sikre et retvisende regnskab må institutionerne efterfølgende foretage refusioner, når den nye opsætning er klar. Det er institutionernes ansvar at sørge for, at ØSC gennemfører de konkrete refusioner.